Sau cuộc chiến kéo dài 12 ngày, trong đó ba cơ sở hạt nhân trọng yếu của Iran bị phá hủy hiệu quả bởi các cuộc không kích của Israel, tình hình nội bộ tại Iran trở nên căng thẳng với sự gia tăng mạnh mẽ các biện pháp trấn áp an ninh. Chính quyền nước này đã tiến hành hàng loạt vụ bắt giữ và thi hành án tử hình nhằm kiểm soát tình hình bất ổn trong nước.

Ngay sau khi Israel phát động các cuộc không kích vào ngày 13 tháng 6, lực lượng an ninh Iran đã triển khai chiến dịch bắt giữ quy mô lớn kết hợp với việc tăng cường hiện diện quân sự trên đường phố, đặc biệt là ở những khu vực có dân tộc thiểu số như vùng Kurdistan. Các điểm kiểm tra tạm thời được thiết lập khắp nơi để kiểm soát người dân; họ bị yêu cầu trình điện thoại và mở ứng dụng nhắn tin để lực lượng chức năng rà soát thông tin liên lạc. Một người dân Tehran cho biết chỉ cần một dòng tweet hay bài đăng trên mạng xã hội bị coi là nhạy cảm cũng có thể dẫn đến việc bị bắt giữ.
Theo báo cáo từ nhiều nguồn tin và tổ chức nhân quyền, ít nhất 700 người đã bị bắt với cáo buộc liên quan đến chính trị hoặc an ninh quốc gia. Trong số này có những cá nhân bị buộc tội làm gián điệp cho Mossad – cơ quan tình báo Israel – và một số đã bị xử tử vì mang theo “thiết bị ám sát” ngụy trang dưới dạng đồ uống có cồn nhập khẩu trái phép vào Iran. Tổ chức Nhân quyền Iran cảnh báo rằng còn nhiều tù nhân khác đang chờ thi hành án tử hình vì cùng loại cáo buộc.

Chính sách trấn áp nghiêm ngặt này dập tắt hy vọng về một cuộc nổi dậy hoặc thay đổi chế độ mà một số nhóm đối lập trong và ngoài nước từng kỳ vọng sau đợt không kích nhằm vào lực lượng Vệ binh Cách mạng Hồi giáo (IRGC) cùng các cơ sở hạt nhân trọng điểm. Tuy nhiên, chưa xuất hiện biểu tình lớn nào phản đối chính phủ kể từ khi xung đột bùng phát.
Một số ý kiến từ bên trong đất nước bày tỏ sự thất vọng sâu sắc trước chính sách của chế độ hiện tại mà họ cho rằng là nguyên nhân dẫn tới cuộc chiến tranh chống lại Mỹ và Israel. Đồng thời, nhiều người cũng thể hiện thái độ đoàn kết hơn với quốc gia trước những gì họ xem là cuộc chiến tranh phi lý do bên ngoài gây ra.
Trước nguy cơ bất ổn nội bộ lan rộng đặc biệt ở khu vực Kurdistan vốn có truyền thống đấu tranh đòi tự trị, lực lượng Vệ binh Cách mạng cùng các đơn vị Basij được đặt trong trạng thái sẵn sàng cao độ để ngăn chặn mọi dấu hiệu nổi loạn hay hoạt động khủng bố xuyên biên giới từ Pakistan, Iraq hay Azerbaijan.
Việc Quốc hội Iran mới đây thông qua dự luật đình chỉ mọi hợp tác với Cơ quan Năng lượng Nguyên tử Quốc tế (IAEA) càng làm rõ quyết tâm của chính quyền Tehran trong việc củng cố an ninh quốc gia bằng cách ưu tiên công tác phản gián nhằm đối phó với nguy cơ xâm nhập của Israel cũng như các thế lực thù địch khác.
Tổng thể diễn biến cho thấy dù phải chịu tổn thất nghiêm trọng về mặt quân sự sau trận đánh kéo dài gần hai tuần nhưng chế độ Iran vẫn duy trì được quyền kiểm soát nội bộ bằng cách siết chặt quản lý xã hội và thực thi luật pháp hà khắc nhằm duy trì ổn định chính trị trước sức ép cả bên ngoài lẫn bên trong đất nước.